Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KIF5AQ12840 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KIF5AQ12840 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms