Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGNL1Q0VF96 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms