Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
POLR2KP53803 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms