Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOSBP53539 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOSBP53539 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOSBP53539 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms