Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC090093.1-201ENST00000611315 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF4P48230 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 B3GALNT1-204ENST00000417187 1107 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF4P48230 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms