Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LTBRP36941 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms