Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC27P30260 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms