Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA6P23229 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms