Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms