Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRAMEF22A3QJZ6 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms