Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms