Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9Y3F1 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9Y3F1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9Y3F1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9Y3F1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9Y3F1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9Y3F1 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9Y3F1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9Y3F1 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9Y3F1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9Y3F1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9Y3F1 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9Y3F1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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