Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms