Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RAB9BQ9NP90 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms