Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms