Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRTQ9BXP5 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms