Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF3C6Q969F1 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms