Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM43Q6ZSC3 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBM43Q6ZSC3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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