Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TRIM71Q2Q1W2 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TRIM71Q2Q1W2 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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TRIM71Q2Q1W2 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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