Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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