Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SLC25A25-201ENST00000373064 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 DNAJB5-210ENST00000545841 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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