Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms