Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms