Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms