Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 PQLC2L-204ENST00000459838 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms