Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms