Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC27P30260 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC27P30260 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC27P30260 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC27P30260 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC27P30260 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC27P30260 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC27P30260 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC27P30260 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC27P30260 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC27P30260 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC27P30260 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC27P30260 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC27P30260 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC27P30260 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC27P30260 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC27P30260 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms