Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COG3Q96JB2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms