Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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