Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 C9orf64-201ENST00000314700 2067 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 FAM131A-201ENST00000310585 3677 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 EXTL3-AS1-201ENST00000501224 3691 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PRKAG1-205ENST00000547306 1531 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SLC10A1-201ENST00000216540 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SCAMP5-203ENST00000562212 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AIF1L-207ENST00000372309 3515 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ERVMER34-1-201ENST00000440542 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TBC1D3B-202ENST00000611257 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CNOT2-202ENST00000418359 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 DUOXA1-208ENST00000558996 2684 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 FAM84A-202ENST00000331243 3765 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CDC37L1-201ENST00000381854 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TM2D2-202ENST00000456397 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TLR5-201ENST00000366881 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 LINC02140-202ENST00000566649 2017 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 MAP3K3-208ENST00000579585 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ZNF814-215ENST00000614383 2006 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 HADH-210ENST00000626637 1774 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 OSBP2-204ENST00000407373 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TUFT1-204ENST00000392712 2946 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 JAK3-204ENST00000527670 3996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 BCAS1-201ENST00000371435 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 VRTN-201ENST00000256362 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 RP2-201ENST00000218340 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ZFYVE27-203ENST00000359980 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ZNF730-202ENST00000597761 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 MEF2D-202ENST00000360595 3194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ROR2-201ENST00000375708 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 LONP2-203ENST00000535754 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ALDH3A2-219ENST00000579855 3583 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 EME1-207ENST00000511648 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms