Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALD1Q05682 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALD1Q05682 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms