Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CREMQ03060 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms