Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HPGDP15428 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HPGDP15428 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms