Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBQ1P09105 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBQ1P09105 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms