Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
U3KQV3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
U3KQV3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
U3KQV3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
U3KQV3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
U3KQV3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
U3KQV3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
U3KQV3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
U3KQV3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
U3KQV3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
U3KQV3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
U3KQV3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
U3KQV3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
U3KQV3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KQV3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KQV3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KQV3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KQV3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KQV3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KQV3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KQV3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
U3KQV3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
U3KQV3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KQV3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KQV3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KQV3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KQV3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KQV3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KQV3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KQV3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KQV3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KQV3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KQV3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KQV3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
U3KQV3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KQV3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KQV3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KQV3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KQV3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KQV3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KQV3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KQV3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KQV3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KQV3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U3KQV3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U3KQV3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U3KQV3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
U3KQV3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U3KQV3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U3KQV3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U3KQV3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U3KQV3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
U3KQV3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U3KQV3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
U3KQV3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U3KQV3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U3KQV3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U3KQV3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
U3KQV3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U3KQV3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U3KQV3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U3KQV3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U3KQV3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U3KQV3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
U3KQV3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U3KQV3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U3KQV3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U3KQV3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U3KQV3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U3KQV3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U3KQV3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms