Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SEC23IPQ9Y6Y8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC23IPQ9Y6Y8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms