Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KL1Q9Y6S9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KL1Q9Y6S9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KL1Q9Y6S9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms