Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
MAP3K4Q9Y6R4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MAP3K4Q9Y6R4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms