Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USH1CQ9Y6N9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms