Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SNX8Q9Y5X2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX8Q9Y5X2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX8Q9Y5X2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms