Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNPO3Q9Y5L0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNPO3Q9Y5L0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms