Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP15Q9Y4E8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms