Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
WASHC2CQ9Y4E1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
WASHC2CQ9Y4E1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
WASHC2CQ9Y4E1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms