Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms