Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC43.67■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC43.64■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC43.63■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
DCAF1Q9Y4B6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC43.62■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC43.61■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC43.6■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC43.58■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC43.57■■■■■ 4.57
DCAF1Q9Y4B6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC43.57■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC43.56■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC43.55■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC43.54■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC43.53■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms