Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B5

MTCL1, Microtubule cross-linking factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCL1Q9Y4B5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTCL1Q9Y4B5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTCL1Q9Y4B5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MTCL1Q9Y4B5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTCL1Q9Y4B5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTCL1Q9Y4B5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTCL1Q9Y4B5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms