Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP3Q9Y446 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms