Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
R3HCC1Q9Y3T6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
R3HCC1Q9Y3T6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms