Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9Y3F1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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