Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED7Q9Y3B3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED7Q9Y3B3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED7Q9Y3B3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED7Q9Y3B3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED7Q9Y3B3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED7Q9Y3B3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED7Q9Y3B3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED7Q9Y3B3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED7Q9Y3B3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED7Q9Y3B3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED7Q9Y3B3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED7Q9Y3B3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED7Q9Y3B3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms